Theo quy định tại Điều 180 Luật Sở hữu trí tuệ, người nộp đơn đăng ký bảo hộ quyền đối với giống cây trồng được quyền rút đơn đăng ký bảo hộ trước khi cơ quan quản lý nhà nước về quyền đối với giống cây trồng quyết định cấp hay từ chối cấp bằng bảo hộ giống cây trồng. Yêu cầu rút đơn phải được lập thành văn bản.

Từ thời điểm người đăng ký rút đơn đăng ký bảo hộ, mọi thủ tục tiếp theo liên quan đến đơn đó bị chấm dứt; các khoản phí, lệ phí đã nộp liên quan đến những thủ tục chưa bắt đầu tiến hành được hoàn trả theo yêu cầu của người đăng ký.