Căn cứ Khoản 2 Điều 28 Thông tư số 111/2013/TT-BTC ngày 15/08/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn về thuế TNCN:

“Đối với cá nhân đã ủy quyền quyết toán thuế cho tổ chức, cá nhân trả thu nhập thực hiện quyết toán thay thì việc hoàn thuế của cá nhân được thực hiện thông qua tổ chức, cá nhân trả thu nhập. Tổ chức, cá nhân trả thu nhập thực hiện bù trừ số thuế nộp thừa, nộp thiếu của các cá nhân. Sau khi bù trừ, nếu còn số thuế nộp thừa thỉ được bù trừ vào kỳ sau hoặc hoàn thuế nếu có đề nghị hoàn trả”.

Căn cứ quy định nêu trên, trường hợp của công ty thực hiện quyết toán thuế TNCN cho các cá nhân ủy quyền cho công ty quyết toán thuế thay có phát sinh người nộp thừa, người nộp thiếu thì công ty thực hiện bù trừ giữa người nộp thừa và người nộp thiếu. Sau khi bù trừ, nếu còn số thuế nộp thừa thì được bù trừ vào kỳ sau hoặc hoàn thuế nếu có đề nghị hoàn trả.