Theo quy định tại khoản 2 Điều 22 Thông tư 16/2013/TT-BNNPTNT, trình tự, thời gian xử lý đơn yêu cầu hủy bỏ hiệu lực bằng bảo hộ giống cây trồng như sau:

- Trong thời hạn năm (05) ngày làm việc kể từ ngày nhận hồ sơ, Văn phòng bảo hộ giống cây trồng mới xác định tính đầy đủ theo quy định của hồ sơ, gửi yêu cầu bổ sung trong trường hợp hồ sơ chưa đầy đủ theo quy định;

- Trường hợp lý do đề nghị hủy bỏ hiệu lực bằng bảo hộ là do giống cây trồng không đáp ứng tính mới hoặc chủ bằng bảo hộ là người không có quyền nộp đơn: trong thời hạn ba mươi (30) ngày làm việc kể từ khi nhận được hồ sơ đầy đủ theo quy định, Cục trưởng Cục Trồng trọt ký quyết định hủy bỏ hiệu lực bằng bảo hộ, ghi nhận vào Sổ đăng ký quốc gia và thông báo từ chối đề nghị hủy bỏ, có nêu rõ lý do và công bố trên website của Văn phòng bảo hộ giống cây trồng mới trong thời hạn năm (05) ngày làm việc kể từ ngày ký quyết định hoặc trên Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển nông thôn.

- Trường hợp lý do đề nghị hủy bỏ hiệu lực bằng bảo hộ là do giống cây trồng không đáp ứng tính khác biệt hoặc tính đồng nhất hoặc tính ổn định: trong thời hạn (10) ngày làm việc kể từ khi kết thúc thẩm định kết quả khảo nghiệm lại, Cục trưởng Cục Trồng trọt ký quyết định hủy bỏ hiệu lực bằng bảo hộ, ghi nhận vào Sổ đăng ký quốc gia hoặc thông báo từ chối đề nghị hủy bỏ, có nêu rõ lý do và công bố trên website của Văn phòng bảo hộ giống cây trồng mới trong thời hạn năm (05) ngày làm việc kể từ ngày ký quyết định hoặc trên Tạp chí Nông nghiệp và Phát triển nông thôn.