Căn cứ Khoản 19 Điều 16 Luật thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2016 quy định miễn thuế cho:

“19. Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu để bảo vệ môi trường, bao gồm:

a) Máy móc, thiết bị, phương tiện, dụng cụ, vật tư chuyên dùng nhập khẩu trong nước chưa sản xuất được để thu gom, vận chuyển, xử lý, chế biến nước thải, rác thải, khí thải, quan trắc và phân tích môi trường, sản xuất năng lượng tái tạo; xử lý ô nhiễm môi trường, ứng phó, xử lý sự cố môi trường;

b) Sản phẩm xuất khẩu được sản xuất từ hoạt động tái chế, xử lý chất thải.”

Nội dung này được quy định chi tiết hơn bởi Điều 25 Nghị định 134/2016/NĐ-CP Quy định chi tiết một số điều và biện pháp thi hành Luật thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu:

“Điều 25. Miễn thuế hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu để bảo vệ môi trường

1. Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu để bảo vệ môi trường được miễn thuế theo quy định tại Khoản 19 Điều 16 Luật thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu.

2. Căn cứ để xác định hàng hóa trong nước chưa sản xuất được thực hiện theo quy định của Bộ Kế hoạch và Đầu tư.

3. Căn cứ để xác định hàng hóa nhập khẩu thuộc danh mục máy móc, thiết bị, phương tiện, dụng cụ, vật tư chuyên dùng nhập khẩu để thu gom, vận chuyển, xử lý, chế biến nước thải, rác thải, khí thải, quan trắc và phân tích môi trường, sản xuất năng lượng tái tạo; xử lý ô nhiễm môi trường, ứng phó, xử lý sự cố môi trường; sản phẩm xuất khẩu được sản xuất từ hoạt động tái chế, xử lý chất thải thực hiện theo quy định của Bộ Tài nguyên và Môi trường.

4. Hồ sơ, thủ tục miễn thuế thực hiện theo quy định tại Điều 31 Nghị định này.”

Trong đó, căn cứ để xác định hàng hóa trong nước chưa sản xuất được thực hiện theo quy định của Bộ Kế hoạch và Đầu tư được quy định bởi Thông tư 01/2018/TT-BKHĐT của Bộ Kế hoạch và Đầu tư về việc ban hành Danh mục máy móc, thiết bị, phụ tùng thay thế, phương tiện vận tải chuyên dùng, nguyên liệu, vật tư, bán thành phẩm trong nước đã sản xuất được.

Riêng căn cứ để xác định hàng hóa nhập khẩu thuộc danh mục máy móc, thiết bị, phương tiện, dụng cụ, vật tư chuyên dùng nhập khẩu để thu gom, vận chuyển, xử lý, chế biến nước thải, rác thải, khí thải, quan trắc và phân tích môi trường, sản xuất năng lượng tái tạo; xử lý ô nhiễm môi trường, ứng phó, xử lý sự cố môi trường; sản phẩm xuất khẩu được sản xuất từ hoạt động tái chế, xử lý chất thải thực hiện theo quy định của Bộ Tài nguyên và Môi trường. Tuy nhiên, tính đến thời điểm này Bộ Tài nguyên và Môi trường chưa ban hành Danh mục hoặc tiêu chí để xác định máy móc, thiết bị, phương tiện, dụng cụ, vật tư chuyên dùng nhập khẩu để bảo vệ môi trường theo quy định tại Khoản 3 Điều 25, Khoản 6 Điều 40 Nghị định 134/2016/NĐ-CP làm căn cứ để cơ quan hải quan áp dụng chính sách thuế cho doanh nghiệp. Do vậy, nếu công ty bạn muốn biết chính xác thiết bị mình nhập khẩu có được hưởng chính sách này không thì công ty bạn cần làm văn bản đề nghị Bộ Tài nguyên và Môi trường xác nhận hàng hóa nhập khẩu phục vụ dự án là hàng hóa nhập khẩu để bảo vệ môi trường theo quy định tại Khoản 19 Điều 16 Luật Thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu số 107/2016/QH13 làm căn cứ để cơ quan hải quan áp dụng chính sách thuế. Sau đó, khi Bộ Tài nguyên và Môi trường chính thức ban hành Danh mục hoặc tiêu chí để xác định máy móc, thiết bị, dụng cụ, vật tư chuyên dùng nhập khẩu để bảo vệ môi trường theo quy định tại Khoản 3 Điều 25, Khoản 6 Điều 40 Nghị định 134/2016/NĐ-CP, nếu hàng hóa nhập khẩu cho dự án không thuộc Danh mục hoặc tiêu chí như xác nhận của Bộ Tài nguyên và Môi trường thì chủ đầu tư phải kê khai nộp thuế, tiền chậm nộp theo quy định.