Căn cứ theo tiểu mục b2 điểm b Khoản 3, Điều 16, Thông tư 219/2013/TT-BTC quy định:

“Điều kiện khấu trừ, hoàn thuế đầu vào của hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu.

Hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu (trừ các trường hợp hướng dẫn Điều 17 Thông tư này) để được khấu trừ thuế, hoàn thuế giá trị gia tăng đầu vào phải có đủ điều kiện và các thủ tục nêu tại Khoản 2 Điều 9 và Khoản 1 Điều 15 Thông tư này, cụ thể như sau:

…

3. Hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu phải thanh toán qua ngân hàng

…

b) Các trường hợp thanh toán dưới đây cũng được coi là thanh toán qua ngân hàng:

…

b.2) Trường hợp cơ sở kinh doanh xuất khẩu sử dụng tiền thanh toán hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu để góp vốn với cơ sở nhập khẩu ở nước ngoài, cơ sở kinh doanh phải có đủ điều kiện thủ tục, hồ sơ như sau:

- Hợp đồng góp vốn.

- Việc sử dụng tiền thanh toán hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu để góp vốn vào cơ sở nhập khẩu ở nước ngoài phải được quy định trong hợp đồng xuất khẩu.

- Trường hợp số tiền góp vốn nhỏ hơn doanh thu hàng hóa xuất khẩu thì số tiền chênh lệch phải thực hiện thanh toán qua ngân hàng theo hướng dẫn tại điểm này.

…”

Vậy, căn cứ hướng dẫn nêu trên và công ty bạn đang lo lắng về điều kiện đòi hỏi trong hoạt động khấu trừ và hoàn thuế giá trị gia tăng đầu vào cho lô hàng là không có chứng từ thanh toán qua ngân hàng. Tuy vậy với quy định trên, trong trường hợp trên, công ty bạn không cần phải có chứng từ thanh toán qua ngân hàng mà công ty bạn cần phải có đủ điều kiện thủ tục, hồ sơ như sau:

- Hợp đồng góp vốn.

- Việc sử dụng tiền thanh toán hàng hóa, dịch vụ xuất khẩu để góp vốn vào cơ sở nhập khẩu ở nước ngoài phải được quy định trong hợp đồng xuất khẩu.

- Trường hợp số tiền góp vốn nhỏ hơn doanh thu hàng hóa xuất khẩu thì số tiền chênh lệch phải thực hiện thanh toán qua ngân hàng theo hướng dẫn tại điểm này.

Nếu công ty bạn có hồ sơ trên và thỏa mãn các điều kiện khác theo quy định của pháp luật thì công ty bạn sẽ được khấu trừ và hoàn thuế giá trị gia tăng đầu vào cho lô hàng trên mà không cần phải có chứng từ thanh toán qua ngân hàng.