Căn cứ vào Khoản 1 Điều 18 Luật thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu 2016:

“Điều 18. Giảm thuế

1. Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu đang trong quá trình giám sát của cơ quan hải quan nếu bị hư hỏng, mất mát được cơ quan, tổ chức có thẩm quyền giám định chứng nhận thì được giảm thuế.

Mức giảm thuế tương ứng với tỷ lệ tổn thất thực tế của hàng hóa. Trường hợp hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu bị hư hỏng, mất mát toàn bộ thì không phải nộp thuế.

…”

Điều này được chi tiết hơn tại Khoản 1 Điều 32 Nghị định 134/2016/NĐ-CP Quy định chi tiết một số điều và biện pháp thi hành Luật thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu:

“Điều 32. Giảm thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu

1. Hàng hóa xuất khẩu, nhập khẩu đang trong quá trình giám sát của cơ quan hải quan theo quy định tại Luật hải quan năm 2014 và các văn bản hướng dẫn thi hành, nếu bị hư hỏng, mất mát do nguyên nhân khách quan được giảm thuế theo quy định tại Khoản 1 Điều 18 Luật thuế xuất khẩu, thuế nhập khẩu.

…”

Do vậy, căn cứ vào các quy định, có thể thấy hàng hóa nhập khẩu bị hư hỏng sẽ được giảm thuế nhập khẩu khi thỏa mãn các điều kiện:

i) hàng hóa nhập khẩu đang trong quá trình giám sát của cơ quan hải quan;

ii) sự hư hỏng, mất mát do nguyên nhân khách quan;

iii) có đủ hồ sơ theo quy định.

Theo đó, chỉ khi thỏa mãn các điều kiện này thì hàng hóa nhập khẩu mới có thể được cơ quan hải quan chấp nhận cho giảm thuế nhập khẩu.

Đối chiếu với thông tin bạn cung cấp thì rõ ràng lô hàng trên không thỏa mãn điều kiện ban đầu vì hàng hóa này đã thông quan nên không còn trong sự giám sát của hải quan nữa. Vì vậy, công ty bạn không thể làm thủ tục yêu cầu cơ quan hải quan xem xét giảm thuế nhập khẩu cho lô hàng này.