Hiện nay, căn cứ vào quy định tại Khoản 10 Điều 3 Nghị định số 209/2013/NĐ-CP ngày 18/12/2013 quy định chi tiết và hướng dẫn thi hành một số điều của Luật thuế giá trị gia tăng về đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng thì:

“10. Trường hợp chuyển giao công nghệ, chuyển nhượng quyền sở hữu trí tuệ theo quy định tại Khoản 21 Điều 5 Luật thuế giá trị gia tăng mà có kèm theo chuyển giao máy móc, thiết bị thì đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng tính trên phần giá trị công nghệ, quyền sở hữu trí tuệ chuyển giao, chuyển nhượng; trường hợp không tách riêng được thì thuế giá trị gia tăng được tính trên cả phần giá trị công nghệ, quyền sở hữu trí tuệ chuyển giao, chuyển nhượng cùng với máy móc, thiết bị”.

Đồng thời căn cứ quy định tại Khoản 21 Điều 4 Thông tư số 219/2013/TT-BTC ngày 31/12/2013 của Bộ Tài chính hướng dẫn về đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng:

“21. Chuyển giao công nghệ theo quy định của Luật chuyển giao công nghệ; chuyển nhượng quyền sở hữu trí tuệ theo quy định của Luật sở hữu trí tuệ. Trường hợp hợp đồng chuyển giao công nghệ, chuyển nhượng quyền sở hữu trí tuệ có kèm theo chuyển giao máy móc, thiết bị thì đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng tính trên phần giá trị công nghệ, quyền sở hữu trí tuệ chuyển giao, chuyển nhượng; trường hợp không tách riêng được thì thuế giá trị gia tăng được tính trên cả phần giá trị công nghệ, quyền sở hữu trí tuệ chuyển giao, chuyển nhượng cùng với máy móc, thiết bị”.

Căn cứ vào các quy định cho thấy về nguyên tắc hoạt động chuyển giao công nghệ, chuyển giao quyền sử dụng đối tượng sở hữu trí tuệ thuộc đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng. Tuy nhiên, vì thông tin bạn cung cấp chưa cụ thể nên chúng tôi tạm chia thành 2 trường hợp sau:

i) Trong trường hợp hợp đồng chuyển giao công nghệ không kèm theo chuyển giao máy móc, thiết bị thì hoạt động này không chịu thuế giá trị gia tăng nên công ty bạn không phải nộp thuế giá trị gia tăng tại khâu nhập khẩu.

ii) Trong trường hợp hợp đồng chuyển giao công nghệ có kèm theo chuyển giao máy móc, thiết bị thì chỉ có phần giá trị công nghệ chuyển giao là đối tượng không chịu thuế giá trị gia tăng, còn phần máy móc thiết bị kèm theo vẫn là đối tượng chịu thuế giá trị gia tăng. Vì vậy, công ty bạn vẫn phải kê khai và nộp thuế giá trị gia tăng cho phần máy móc, thiết bị kèm theo này. Trong trường hợp công ty bạn không tách riêng được phần giá trị công nghệ chuyển giao và phần giá trị của máy móc, thiết bị đi kèm theo thì thuế giá trị gia tăng được tính trên cả phần giá trị công nghệ, quyền sở hữu trí tuệ chuyển giao, chuyển nhượng cùng với máy móc, thiết bị.