Ở thời điểm hiện tại đã có Luật Công nghệ cao năm 2008  và quy chế khu CNC theo Nghị định số 99/2003/NĐ-CP cũng như các văn bản được xây dựng, ban hành để hướng dẫn Nghị định. Tuy nhiên đã lỗi thời, có nhiều điểm không còn phù hợp và không theo kịp với thực tiễn của các khu CNC trong cả nước. Do đó, Chính phủ đã có dự thảo Nghị định mới quy định về khu CNC, trong dự thảo cũng nêu rõ những ưu đãi đầu tư đối với khu CNC như:

-   Nhà nước khuyến khích, hỗ trợ nhà đầu tư xây dựng hệ thông kết cấu hạ tầng kỹ thuật CNC;

-   Khu CNC là địa bàn ưu đãi đầu tư và thuộc danh mục địa bàn có điều kiện kinh tế - xã hội đặc biệt khó khăn theo pháp luật về đầu tư;

-   Ưu đãi về đất đai, thuế thu nhập doanh nghiệp, thuế xuất – nhập khẩu, thuế thu nhập cá nhân, thuế sử dụng đất phi nông nghiệp của dự án đầu tư vào khu CNC;

-   Ưu đãi, hỗ trợ đầu tư đặc biệt được áp dụng để khuyến khích phát triển một số dự án đầu tư có tác động lớn đến phát triển kinh tế - xã hội;

-   Tổ chức, cá nhân có dự án đầu tư vào khu CNC được cơ quan có thẩm quyền hỗ trợ thự hiện các thủ tục hành chính về đầu tư, doanh nghiệp, đất đai, xây dựng, môi trường, lao động, thương mại theo cơ chế “một cửa”, “một cửa liên thông” và các vấn đề liên quan khác trong quá trình triển khai thực hiện dự án;

-   Doanh nghiệp khu CNC có đầy đủ quyền hạn, nghĩa vụ của nhà đầu tư theo quy định của pháp luật về đầu tư, pháp luật về doanh nghiệp và pháp luật khác có liên quan;

…

Về thực tiễn, những ưu đãi hiện nay ở khu Công nghệ cao TPHCM như:

-   Mức ưu đãi đầu tư cao nhất về tiền thuê đất, Thuế thu nhập doanh nghiệp(10%) trong vòng 15 năm trong đó 04 năm đầu đực miễn thuế (0%) và 9 năm tiếp theo được giảm 50% (5%)…dành cho các dự án CNC. Ngoài ra, nhà đầu tư còn được miễn thuế nhập khẩu cho: Máy móc, trang thiết bị, phương tiện vận chuyển chuyên dụng (trên 24 chỗ) nhập khẩu để tạo tài sản cố định; Nguyên vật liệu xây dựng tài cản cố định trong nước chưa sản xuất được – Bán thành phẩm, linh kiện nhập khẩu để gia công thành phẩm;

-   Khu CNC được ủy quyền thực hiện thủ tục một cửa tại chỗ cho nhà đầu tư bao gồm: ưu đãi công nghệ cao, giấy chứng nhận đầu tư, hải quan tại chỗ và các loại giấy phép khác.

-   Sự cam kết ủng hộ mạnh mẽ của Chính phủ và Ủy ban nhân dân TP.HCM

-   Một môi trường định vị cho các hoạt động CNC, với sự hiện diện của các tập đoàn CNC như Intel, các doanh nghiệp công nghiệp phụ trợ và các doanh nghiệp nghiên cứu- triển khai trong và ngoài nước.

-   Xin visa nhiều lần cho người nước ngoài làm việc cho dự án; Hỗ trợ về tuyển dụng, đào tạo, tư vấn pháp lý, vốn mồi, dịch vụ xe buýt.

-   Trung tâm đào tạo và trung tâm R&D với các hình thức hỗ trợ (sử dụng trang thiết bị phòng lab tại trung tâm R&D của khu CNC), hợp tác đa hướng đến doanh nghiệp.

…